Poprzez SZOI można przesyłać następujące dokumenty elektroniczne:
- deklaracje POZ (pliki o rozszerzeniu *.pdx)

- raport zbiorczy POZ (pliki o rozszerzeniu *.pzx);

- komunikat świadczeń ambulatoryjnych i szpitalnych I fazy /raporty statystyczno-medyczne/ (pliki o rozszerzeniu *.swx);

- komunikat świadczeń ambulatoryjnych i szpitalnych II fazy /raporty rozliczeniowe/ (pliki o rozszerzeniu *.wsx);

- rachunki refundacyjne / korekty (pliki o rozszerzeniu *.rfx);

- rachunki/faktury elektroniczne (pliki o rozszerzeniu *.erx i *.efx);

- kolejki oczekujących oraz informacje o pierwszym wolnym terminie (pliki o rozszerzeniu *.klx).

- faktury zakupowe leków (pliki o rozszerzeniu *.fzx);

Natomiast zwrotnie można pobrać następujące dokumenty elektroniczne:

- plik z umową/aneksem (w formacie XML pliki o rozszerzeniu *.umx);

- raporty zwrotne do raportów statystycznych (pliki o rozszerzeniu *.swz);

- raporty zwrotne do raportów rozliczeniowych z szablonami rachunków (pliki o rozszerzeniu *.wsz) - dla umów w modelu rozliczania po stronie Świadczeniodawcy;

- raporty zwrotne do żądania rozliczenia z szablonami rachunków (pliki o rozszerzeniu *.zrz) - dla umów w modelu rozliczania po stronie Płatnika oraz dla umów POZ związanych z rozliczaniem deklaracji;

- raporty zwrotne list POZ:

   - pliki z deklaracjami błędnymi - (plik  o rozszerzeniu *.pzp)

   - pliki z deklaracjami nieuznanumi - (plik  o rozszerzeniu *.pzw)

   - pliki z ilością deklaracji uznanych - (plik  o rozszerzeniu *.pzr)

- raport zwrotny kolejki oczekujących - (plik o rozszerzeniu *.plz)

- potwierdzenia przesłania dla każdego rodzaju komunikatu;